Nhà văn Dani Cavallaro mô tả "Kiseki no kachi wa" là một tập phim "hướng trục đến thế giới của Evangelion".[31] Xuyên suốt tập phim là quá trình khám phá tâm lý của Shinji cũng như mối quan hệ của anh với Katsuragi Misato.[32][33] Một chủ đề khác là mô tả thế giới nội tâm của Shinji và Misato[34] cùng những nghi ngờ về lý do thực sự của Shinji khi quyết định lái chiếc Eva-01.[35] Tập phim là đạt đỉnh tích cực và nhẹ nhàng trong tiểu phần hành động của loạt phim, trong đó mối quan hệ của các nhân vật chính dường như đã đi đến hồi kết và câu chuyện hướng đến một kết thúc có hậu.[36][37] Lấy ví dụ, Gendo — một người cha lạnh lùng và xa cách trong những tập đầu tiên, đã chúc mừng và khen ngợi Shinji.[38][39] Sau sự kiện này, Shinji nhận ra rằng cậu chỉ lái chiếc Eva-01 để được phụ huynh chấp thuận, và cậu rất hạnh phúc khi được cha khen ngợi.[40] Cây viết Dennis Redmond cho rằng những lời khen ngợi của Gendo có "đôi chút bất thường" đối với văn hóa Nhật Bản vốn "có xu hướng công nhận thành tích tập thể hơn là thành tích cá nhân".[41] Mặt khác, Misato thể hiện niềm tin lớn vào khả năng của con người trong diễn biến của cốt truyện, đồng thời từ bỏ thái độ thuyết định mệnh hoặc tất định, lặp lại chủ đề tượng trưng trong tác phẩm của Anno Hideaki.[42]

Trong "Kiseki no kachi wa", Soryu Langley Asuka đặc trưng bởi tính cách cục cằn và kiêu căng, đồng thời tỏ vẻ khó chịu với thành tích của đồng nghiệp Shinji.[43] Gualtiero Cannarsi coi hành vi của cô là phản kháng nam tính — một thuật ngữ tâm lý học để chỉ dạng nổi loạn có thể nhận thấy ở những phụ nữ cảm thấy mệt mỏi với vai trò rập khuôn gắn liền với giới tính nữ.[25] Asuka hành động như thể cô bé cố chứng tỏ bản thân và vượt qua giới tính nam, với sự pha trộn giữa "mặc cảm tự ti" và "ganh đua triệt để".[44]

Trong diễn biến của tập phim, Asuka định nghĩa thế hệ của Misato — thế hệ đã trực tiếp trải qua Chấn động thứ hai và hậu quả của nó, là một "thế hệ sinh ra trong nghèo khó".[45] Cụm từ "Thế hệ Chấn động thứ hai" cũng được nhắc đên trong chương trình phát thanh ở một phân cảnh khác của tập phim, Gualtiero Cannarsi ví cụm từ này với "thế hệ chiến tranh".[45] Trong công cuộc chuẩn bị cho cuộc đụng độ với Sahaquiel, tập phim cũng nhắc đến thị trấn Matsushiro — nơi đặt bộ phận thứ hai của Nerv. Ở thế giới thực, tại khu vực Matsushiro, các kế hoạch đã được tiến hành để xây dựng trụ sở đế quốc dưới lòng đất, dự kiến sử dụng sau Thế chiến thứ hai.[46][47]

Ngoài ra "Kiseki no kachi wa" còn lấy chủ đề tôn giáo, đặc biệt là đạo Do Thái và Cơ đốc giáo. Ở phân cảnh đầu tiên của tập phim, Adam — Angel đầu tiên, lần đầu được khắc họa dưới hình dạng một người khổng lồ của ánh sáng.[48][49] Nhà phê bình Marc MacWilliams chỉ ra rằng Adam của Evangelion thể hiện "như trong các văn bản Kabbalah trước khi anh sa ngã".[50] Ở phân cảnh khác, một hạm đội hàng hải vận chuyển một vật thể khổng lồ có tên là Ngọn giáo Longinus trên một tàu sân bay,[51][52] tên của vật xuất phát từ thánh tích huyền thoại cùng tên của Cơ đốc giáo. Ở cùng phân cảnh ấy, Ikari Gendo và Fuyutsuki Kozo bàn luận về nguyên nhân gây ra Chấn động thứ hai cũng như nhắc đến khái niệm Cơ đốc giáo về tội tổ tông;[53] cây viết Dennis Redmond mô tả cuộc trò chuyện của họ "gần như thần học".[54] Trong cuộc thảo luận, những cột muối[8][55] là bố cục khắp vùng nước đỏ ở Nam Cực. Theo Kogod của Comic Book Resources đã so sánh biển tan chảy ở Nam Cực với Sách Khải Huyền, trong đó biển chuyển sang màu đỏ tựa như máu.[56] Những cột muối tạo nên liên tưởng đến Sodom và Gomorrah cùng tình tiết vợ của Lot hóa thành một bức tượng muối.[19] Trong Evangelion, Fuyutsuki cho rằng Chấn động thứ hai là một "hình phạt" giáng xuống nhân loại vì tội ác của họ, gọi Nam Cực — nơi không loài nào có thể sinh sống là "một Biển Chết thật". Trên thực tế, Sodom và Gomorrah nằm gần cực nam của Biển Chết — một môi trường được biết đến là hoàn toàn không có lợi cho sự sống bất kỳ loài thủy sinh nào do độ mặn cực cao của nó.[57]